从1990年代PC机遍及的运用Windows 3.x开端，DR-DOS体系被逐渐被MS-DOS替代。到1995年全面选用Windows 95时，DOS的影响开端减小，DR-DOS也随之在桌面商场敏捷式微。1999年，DR-DOS推出7.03版别，随后在一段时间内一向未有正式更新。现在DR-DOS在单任务嵌入式设备中还有少数运用，还有极少数DOS爱好者还在研讨或运用DR-DOS。

  2004年，DR-DOS推出了8.0版，功能上仅做了很小修正，支撑FAT32和大容量硬盘。2005年又曾一度推出DR-DOS 8.1版，但由于版权胶葛，随后DR-DOS 8.x从商场上撤回。现在其公司开端从头出售DR-DOS 7.03版别。